تتمتع الجامعة بعضوية :

الاتحاد العالمي للجامعات .

اتحاد جامعات العالم الإسلامي .

اتحاد الجامعات السودانية  .

اتحاد الجامعات العربية .

اتحاد الجامعات الإفريقية .

رابطة الجامعات الإسلامية.