هناك اتفاقيات ثنائية، ومذكرات تفاهم  للتعاون العلمي، والثقافي مع عدد من الجامعات والمؤسسات العلمية العالمية، والإسلامية مثل :

جامعة الملك فيصل بأنجمينا ( تشاد ).

الاتحاد العالمي للمدارس العربية والإسلامية.

الجامعة الإسلامية العالمية بماليزيا.

جامعة آل البيت بالأردن.

الجامعة الإسلامية بالنيجر.

جامعة أمبالى بيوغندا.

جامعة جنوب إفريقيا

كلية الشريعة بسراييفو.

كلية الكانمى بنجيريا.

كلية التربية الجامعية ( زنجبار )، وهى تنتسب علمياً إلى الجامعة ، وتمنح خريجيها درجة البكلاريوس.

كلية ثيكا للشريعة، والعلوم الإسلامية، في كينيا، وهى تنتسب علمياً إلى الجامعة ، وتمنح خريجيها درجة البكلاريوس.

جامعة الحكمة - نيجيريا.

كلية كساؤني – ممبسا -كينيا.

كلية القران الكريم والعلوم الاسلامية-غانا.

جامعة شرق إفريقيا - بوصاصو - الصومال.

جامعة Prince - تايلاند.

الجامعة الإسلامية العالمية - إسلام أباد - باكستان.

جامعة بنادر - الصومال.

جامعة أديس أبابا - أثيوبيا.

الجامعة الإسلامية البورندية ( كوميبو ) - بورندى.

الهيئة العالمية لتحفيظ القرآن برابطة العالم الإسلامي.

مشروع عيون الحياة الخيرى.

منظمة رعاية الطلاب الوافدين.

الندوة العالمية للشباب الإسلامى .

مكتب التعاون للدعـــوة والإرشاد ( ساحل العاج ).

الشيخ على كترجوغلي ( رجل أعمال تركي ) لبناء المسجد العثماني.

شركة عبدالله هاشم عروة ( المملكة العربية السعودية ) - منح دراسية.

ولاية كاتسينا ( نيجيريا ) - منح دراسية.

جامعة برعو ( الصومال ).

اتحاد الدعاة المسلمين ( سيراليون ) - منح دراسية.

جامعة الشافعية الإسلامية بجاكارتا - إندونيسيا.

الكلية العربية الإصلاحية في سيرلانكا.

جامعة خانان الصينية لعلوم الطب التقليدي البديلة.

مذكرة تفاهم بين حكومة السودان، وحكومة إندونسيا حول التعاون في مجال التعليم، والشؤون الدينية.

إتفاق تفاهم بين معهد اللغة العربية جامعة إفريقيا العالمية، وشعبة اللغة العربية بجامعة أديس أبابا.

مذكرة تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية وجامعة زنجبار.

اتفاقية تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة  علاء الدين الإسلامية الحكومية –مكاسر إندونيسيا.

اتفاقية تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، والجامعة الإسلامية إندونيسيا.

اتفاقية تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة والي سونجو الإسلامية إندونيسيا.

مذكرة تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، والاتحاد الإسلامي البورندي.

مذكرة تعاون علمي بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة جزر القمر.

مذكرة تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة شنقيط العصرية.

اتفاقية تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، وجمعية إقراء للعلاقات الانسانية –جدة.

اتفاقية تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، ومنظمة الدعوة الإسلامية وجمعية إقرأ للعلاقات الانسانية.

مقترح اتفاقية بين جامعة إفريقيا العالمية، والمركز الثقافي الندوة العالمية للشباب الإسلامي.

مذكرة تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة سوراكرتا المحمدية – إندونيسيا.

مذكرة تفاهم لانشاء كلية التمريض بين جامعة إفريقيا العالمية، والشيخ عبد الرحمن بن عبد الله.

مذكرة تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، ومعهد حزب الله، ومدارس الفتح – إندونيسيا

مذكرة تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة ولاية كيبي –نيجيريا.

مذكرة تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة نايف العربية للعلوم الامنية.

مذكرة تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية ومركز الملك فيصل للبحوث والدراسات الإسلامية.

مذكرة تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، وهيئة الإغاثة العالمية المملكة العربية السعودية.

طلب تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، وجمعية تطوير الثقافة والتعليم للاقليات – قانسو.

اتفاقية تعاون مشترك بين جامعة إفريقيا العالمية، ومعهد اللغات العالمية للمسلمين بنيغشيا.

مذكرة تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة أدرار- الجزائر.

مذكرة تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، وكلية دار العلوم الإسلامية – ماليزيا.

طلب تآخي وتعاون من معهد الخوارزمي – السعودية مع جامعة إفريقيا العالمية.

مقترح اتفاقية تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة اسيوط، وجامعة الزانترناشونال.

مذكرة تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية في السودان، وجامعة نانشانق بالصين.

اتفاقية تعاون بين جامعة افريقيا العالمية، في السودان، ومعهد السلام للتدريب-ملاوي.

اتفاقية تعاون بين جامعة افريقيا العالمية، وجمعية تشينغهاي للقوميات- شينيغ-الصين في مجال التبادل الطلابي لدراسة اللغة العربية، والدراسات العليا.

اتفاقية تعاون بين جامعة افريقيا العالمية، كلية العلوم الإسلامية والتطبيقية (تعز-اليمن).

مذكرة تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، جامعة سبها – الجماهيرية العظمى.

اتفاقية تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة بانقي-أفريقا الوسطى.

مذكرة تفاهم بين مركز البحوث والدراسات الإفريقية، بجامعة إفريقيا العالمية، ومدير عام مركز البحوث  الدراسات الإفريقية.

مذكرة تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، ومؤسسة الإيمان (جوهانسبيرج – جنوب إفريقيا).

مذكرة تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، وعبد الرحمن بن عبدالله آل الشيخ.

مذكرة  تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، والكلية الأولية أديس أبابا.

توأمة بين جامعة إفريقيا العالمية، و المعهد العالي لإعداد وتأهيل المعلمين – هرجيسا-الصومال.

توأمة بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة بايرو.

مذكرة تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة بريتوريا – القاهرة.

مذكرة  تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، معهد الدراسات اللغوية – جامعة أديس أبابا.

مذكرة تعاون بين مركز الدراسات والأبحاث في جيبوتي وبين مركز البحوث والدراسات الإفريقية في السودان.

مذكرة تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، جامعة أنجمينا – تشاد.

مذكرة  تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، والمعهد اللاتيني الأمريكي للدراسات الإسلامية بالبرازيل.

مذكرة تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، والمعهد الإسلامي بداكار.

مذكرة  تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، والمؤسسة الإسلامية للثقافة والتنمية – سريلانكا.

مذكرة  تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة كسلا.

مذكرة  تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، وكلية رأف الجامعية – كينيا.

برتوكول تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، والتجمع الثقافي الإسلامي بموريتانيا.

مذكرة تعاون وشراكة بين جامعة إفريقيا العالمية، والهيئة الإسلامية العالمية للتعليم.

مذكرة  تفاهم بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة بنادر بالصومال.

مذكرة  تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، وجامعة الجزيرة بالسودان.

مذكرة  تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، وكلية سلطان للعلوم التربوية المتخصصة بالهند.

مذكرة  تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية، و مؤسسة التعليم السويسرية.

مذكرة تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية،  وادارة التربية و التعليم بننغيشيا –الصين.

مذكرة تعاون  بين جامعة إفريقيا العالمية، ومعهد العرفان الإسلامي بكينيا. 

مذكرة تعاون  بين جامعة إفريقيا العالمية، والهيئة الإسلامية العالمية – مكتب النيجر.

مذكرة تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية،  مجمع الرحمة التنموي – جمهورية جيبوتي.

مذكرة تعاون جامعة الجنرال  لانسانا كونتي بسونفيا كوناكري – غينيا.

مذكرة تعاون معهد الدراسات الإسلامية – لينشيا قانسو -  الصين.

مذكرة تعاون بين جامعة إفريقيا العالمية،Istanbul Medeniyet University.

مذكرة تفاهم  بين جامعة إفريقيا العالمية وجامعة دار السلام كنتور / اندونيسيا.

مذكرة تفاهم  بين جامعة إفريقيا العالمية وجامعة بخارست – رومانيا.

مذكرة تفاهم  بين جامعة إفريقيا العالمية وجامعة ادم بركة – تشاد.

مذكرة تفاهم  بين جامعة إفريقيا العالمية وجامعة الإمام الشافعي – الصومال.

مذكرة تفاهم  بين جامعة إفريقيا العالمية وزارة التربية والتعليم  بولاية بونت لاند –الصومال.

مذكرةتفاهم  بين جامعة إفريقيا العالمية ومجلس السلاطين الصوماليين – الصومال.

مذكرةتفاهم  بين جامعة إفريقيا العالمية وجامعة عبد الله بن ياسين – موريتانيا.

مذكرةتفاهم  بين جامعة إفريقيا العالمية ومعهد النهضة للغة العربية – بوصاصو – الصومال.

مذكرةتفاهم  بين جامعة إفريقيا العالمية والجامعة الاسلامية يوغندا.

مذكرة تفاهم  بين جامعة إفريقيا العالمية وجامعة عبد الرحمن الصميت – زنجبار.

إتفاقية إتحاد الجامعات الأسيوية